效益工资按各科收入减支出的余额，确定各科室提取比例。
对于收入减支出后无余额的科室，医院只发放基本工资。
各科根据收入，具体提取比例不同，所有科室提取比例均为试行，医院可随时根据科室收入预以调整。
所有科主任的操心费每月提升至两千元，诊疗组长也调整到五百元，凸显了中层管理人员的重要性。
为提高急诊科人员主观能动性、多拉快跑，提高病人救治率，急诊科人员基本工资按医院标准执行，效益工资部分由两部分组成∶科室收入提取比例为3.6%。每接回一个病人（死亡除外）按200元补贴给科室。急诊科不得私自截留住院病人，发现一例该转未转的病人，扣科室效益工资总额的5%作为处罚。
普通行管后勤人员享受全院医技科室平均奖的85%。
各科转送ICU的病人，其收入的30%划入该科收入。
内退人员的工资待遇按内退时比例同比例提高基本工资。
科室收入的构成也进行了详细规定和调整。临床科室收入组成为，药品收入的25%，辅助检查收入的30%，其中5%核算到个人，手术费的60%，这其中不包括专家手术费，治疗收入，护理收入，床位收入，材料收入的100%。
手术室∶手术材料费的100%加上手术费的40%。麻醉科∶麻醉费的100%加麻醉材料费的100%以及药品费的25%。
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