脑虫被捕，与此同时，各地的战争还在继续。
虫族向新堪萨斯殖民地发射了一个虫舱。当地人意识到虫族的入侵后，警告当局并试图逃离。然而，他们很快就惨遭虫族的屠杀，附近的小镇迅速被虫海吞没。最后机动步兵团赶到与虫族血战，最终以巨大的代价惨胜。史称“新堪萨斯战役”。
稍后，《星河战队2：联邦英雄》的剧情线开始。
著名的祖鲁阿尔法战役（BattleofZuluAlpha）。
联邦军队对虫族展开全面进攻，本想一鼓作气结束战斗，但却陷入了持久战，不得不开始挖壕沟，建地堡，搭电网与虫族鏖战。在祖鲁阿尔法星球上，与虫族作战的机动步兵队英勇6组，陷入虫族包围，仅存的小分队，逃到了三角洲酒店前哨站，寻求支援。在这里，士兵们不仅遭遇了成群的虫族兵，还遭遇了可以寄生在人类体内，从而控制人类的新的虫族兵种。这种智慧虫通过口腔进入人的体内，达到神经控制的效果，并且还能在人体内繁殖，通过口腔感染给其他人。是虫族用来消灭人类最新的武器。虫族寄生了一个将军，想让将军潜入联邦的核心，扩大感染，击溃人类。
经过一番殊死搏斗，最终只有一个怀孕的女兵撒哈拉乘坐登陆艇逃离了虫海，把虫族最新武器的消息带给了总部。
而留下来与虫族血战到底的迪克斯，则成为“联邦英雄”，铭牌被光荣的钉在了墙上。
2303年，赫斯佩鲁斯战役（BattleofHesperus）。虫族入侵了矿藏资源丰富的赫斯珀鲁斯星球，这颗星球是联邦为舰队提供燃料的重要星球之一。于是联邦立即予以反击，最终夺回了星球。
此战过后，第一次人虫战争告一段落，总共持续了5年多的时间。
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